暑期学校 | “物种分布模型原理与应用” 北京大学全国研究生暑期学校报名通知

June 07, 2018

一、课程简介

1、暑期学校的说明：

2018年北京大学暑期学校课程“物种分布模型原理与应用”由北京大学研究生院主办，北京大学城市与环境学院承办。物种分布模型（SDM）的应用非常广泛，可以应用于发现新种群或物种、选择和设计保护区、评价入侵物种的风险、寻找生物多样性的历史避难所、以及评价气候变化对物种分布的影响等多个方面。本课程依托北京大学城市与环境学院的生态学科师资力量，邀请物种分布模型领域顶级学者Niklaus E. Zimmermann及其团队，共开设讲座、实训和研讨三个模块的学习内容。课程旨在培养学员的学术研究能力，开阔学员的学术视野，了解生态学科国际前沿。

2、主讲团队简介：

Niklaus E. Zimmermann博士是瑞士联邦研究所研究员、瑞士苏黎世大学教授，国际著名宏观生态学家，SDM领域的顶级学者。在PNAS、Nature Climate Change、Ecology Letters、New Phytologist等生态学顶级杂志累计发表论文300余篇，累计被引23,482次。本次他将带领研究团队内瑞士苏黎世大学助理教授Lo?c C.M. Pellissier博士、瑞士联邦研究所博士后Philipp G. BRUN博士以及苏黎世大学博士研究生Marc GRüNIG来北京大学进行为期5天的物种空间分布模型概念和应用的讲解，并通过具体案例向学员详细介绍如何运用R软件实现物种空间分布模拟的整个过程。

3、课程安排与报到：

课程时间为2018年6月11-15日，6月11到13日为入门课程，14日到15日为进阶课程。主要授课语言为英语。

学员报到时间为2018年6月10日14:00-17:00，报到地点：北京大学艺园402室。经确认报名而未能按时报到的学员，自动视为放弃学员资格。

3、教学内容：

SDM入门课程

Day	Title	Type	Lecturer
Day 1:
9:00	Introduction the 3-day SDM introductory course	L	Zhiheng, Niklaus
9:10	Introduction to niche-based species distribution modelling	L	Niklaus
10:15	Break
10:30	Introduction to GIS in R	L	Lo?c
11:15	Practical on GIS in R	P	Lo?c
12:00	Lunch Break
13:00	Continue practical on GIS in R	P	Lo?c
14:45	Break
15:00	Introduction to statistical modelling for SDMs in R	L	Niklaus
Day 2:
9:00	Practical on LM/GLM	P	Marc
10:30	Break
10:45	Introduction to model testing in R	L	Lo?c
11:30	Practical on model testing in R	P	Marc
12:00	Lunch Break
13:00	Continue practical on model testing in R	P	Marc
14:00	Break
14:15	Introduction to GAM & CART in R	L	Niklaus
15:00	Practical on GAM and CART in R	P	Philipp
Day 3:
9:00	Introduction to model uncertainty, ensembles & CC projections	L	Philipp
10:30	Break
10:45	Practical on ensemble & CC projections in R (with own work)	P	Marc
12:00	Lunch Break
13:00	Continue practical on ensemble projections in R (own work)	P	Marc
14:45	Break
15:00	Discussion on ensemble projections	D	all
15:30	General discussion on species distribution modelling	D	all

SDM进阶课程

Day	Title	Type	Lecturer
Day 1:
9:00	Introduction to the 2-day SDM advanced course	L	Zhiheng, Niklaus
9:10	Advanced species distribution modelling	L	Niklaus
	[Variable selection, correlation among variables, number of variables, sampling size, prevalence,
	parsimony, shape complexity, model selection, explanation/prediction/projection, weighting, etc.]
10:00	Break
10:15	Optimizing SDM model calibrations	P	Niklaus
	[some illustrations and tests on advanced species distribution modelling]
11:15	Joint species distribution modelling	L	Lo?c
12:00	Lunch Break
13:00	Demographic SDMs	L	Lo?c
13:45	Model testing in R	L	Lo?c
	[re-substitution, jackknife, 10-fold/5-fold CV, repeated split sample, independent block tests, …]
14:15	Break
14:30	Practical on model testing	P	Lo?c
	[some illustrations on model testing]
15:30	Introduction to pseudo-absence generation in R	L	Lo?c
	[geographical or environmental stratification, stratification by sampling density, # of pseudoabsences,
	link to sampling design, etc.]
16:15	Break
16:30	Practical on pseudo-absence generation	P	Lo?c
	[some illustrations on pseudo-absence generation and its effects on SDMs]
17:30	Discussion on advanced species distribution modelling	D	all
Day 2:
9:00	Introduction to BIOMOD2 in R	L	Philipp
10:00	Practical on BIOMOD2 in R	P	Philipp
10:30	Break
10:45	Continue practical on BIOMOD2 in R	P	Philipp
12:00	Lunch Break
13:00	Finish practical on BIOMOD2 in R	P	Philipp
14:15	Break
14:30	Introduction to developing flexible SDM functions in R	L	Marc
15:15	Practical on own SDM functions in R	P	Marc
17:00	Discussion on BIOMOD2 and own SDM functions	D	all

Type: L=Lecture; P=Practical; D=Discussion

注：以上安排可能调整，以报到时领取讲座日程为准。

二、招生与结业

本期课程计划招生人数为20-30人

1、招生范围：

全国高校和研究机构中从事生态学研究的研究生、博士后和本专业青年教师，适当考虑已获生态学专业保研资格的高年级本科生。

2、报名方式：

请扫描下图二维码或点击报名链接填写报名表，经审核通过，并收到报名成功的邮件为有效报名。本次暑期学校按照报名先后顺序录取获得有效报名的学员，达到人数上限后自动截止。

报名链接：https://www.wjx.top/jq/24823987.aspx

报名时间截止6月10日24:00

3、报名及报到材料：

a) 本人身份证原件

b) 有效学生证/工作证原件（或所在学校学籍管理部门的在校证明；或人事部门盖章证明）；

c) 请将身份证正反面以及学生证（或工作证）复印到一张A4纸上，暑期学校将留用；

d) 报名表原件及复印件（网站下载，需签字并加盖单位公章）；

4、结业方式：

三、特别说明

1. 学员无须支付学费和杂费，但由于学校宿舍紧张，无法安排同学们在校内住宿，请自行提前预订食宿地点；

2. 如果需要在学校食堂就餐，我们将统一协助办理临时就餐卡。暑期学校期间，补贴每位学员50元/日伙食费；

3. 西部学员来京参加的可报销火车硬座票，动车和高铁票无法报销；

4. 要求参加野外实习的学员购买保险，报到时出具保险证明材料；

5. 未尽事宜请关注后续通知

四、联系方式

如果您有任何关于课程和申请过程的问题，欢迎与我们联系。

联系人：王老师（zhiheng.wang@pku.edu.cn）；

通讯地址：100871北京市北京大学城市与环境学院

北京大学城市与环境学院网址：http://www.ues.pku.edu.cn/

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